Die Menge der Krankheiten, denen man autoimmune Ursachen zuschreibt, ist in den letzten Jahren gestiegen. n Krankheiten zählt, ist mit den Jahren gestiegen. Hierzu zählen u.a. eine Reihe Gicht- und Bindegewebekrankheiten, sowie gewisse Darmkrankheiten. In anderen Fällen greifen Antistoffe die insulinproduzierenden Zellen des Körpers an, worauf Zuckerkrankheit (Diabetes) entsteht. Es sind Autoantistoffe, nach denen man sucht, wenn man entscheiden soll, ob eine Krankeit autoimmun ist.
Auf der Oberfläche alles Zellen, Bakterien, Viren und Stoffen im Ganzen, sitzt eine Molekülstruktur, die charakteristisch für jeden Mikroorganismus und Gewebetyp sind. Diese Strukturen werden Antigene genannt. Wenn die körpereigenen Antistoffe Fremdkörper angreifen, kennen sie den Unterschied zwischen den verschiedenen Zelltyp mit Hilfe eben dieser Oberflächenantigene.
Menschen mir besonderen Gewebetypen werden öfter als andere von Autoimmunen Krankheiten heimgesucht. Die Ursachen für eine solche Fehlkodierung des Immunsystems sind bis heute noch nicht klar; doch häufig kann beobachtet werden, daß Autoimmune Krankheiten nach einem gefühlsmäßigen Schock oder einer Bakterieninfektion ausgelöst werden.
Eine Theorie geht von der Annahme aus, dass eine dünne oder undichte Darmschleimhaut (Siehe Leaky Gut Syndrom) – möglicherweise als Folge einer langwierigen Antibiotika- oder Hormonbehandlung – Stoffe ins Blut übertreten lässt, die das Immunsystem stark belasten oder falsch kodieren.
Andere heftige immunologische Begebenheiten wie z.B. Impfungen standen als auslösender Faktor unter Verdacht; doch diese Theorie hat keine große Ausbreitung gewonnen. Ebenso die Aussetzung von Giftstoffen/Spritzgifen oder der übermäßige Genuß von tierischen Proteinen wurden verdächtigt, Autoimmune Krankheiten auszulösen.
